Contacts

Secrétaire et gestionnaire
Nathalie NAWROT

Faculté Jean Perrin
rue Jean Souvraz - SP 18 
62307 Lens Cedex
Tél : 03 21 79 17 35
Fax : 03 21 79 17 36

Plateforme de spectrométrie de masse

Le plateau technique

            Le Centre de Spectrométrie de masse et d’analyse protéomique de l’Artois est une plateforme multimodale d’analyse moléculaire faisant partie du LBHE. La plateforme est également le plateau technique de référence au sein de l’IFR 114-IMPRT de Lille 2. Elle dispose d’un spectromètre de masse et d’une chaîne de préparation d’échantillons couplés à un équipement informatique permettant de mener à bien des projets de protéomique : identification de protéines à large échelle, quantification, séparation des protéines, protéomique clinique et recherche de biomarqueurs.

Notre centre d’analyse fait partie intégrante du LBHE, en participant activement aux projets du laboratoire, mais est légalement largement ouvert aux entreprises, laboratoires académiques ou aux hôpitaux régionaux et nationaux. Dans ce cadre, de nombreux partenariats ont été développés tout au long de ses 8 années d’existence tant par des activités de prestations de service que par des collaborations scientifiques.

 

La plateforme est labellisée CREST (Centre de Ressources et d’Expertise Scientifique et Technologique, cliquez sur le lien)  . Par cette labellisation, la structure s’engage à délivrer des prestations de qualité répondant aux critères de confidentialité, de réactivité et d’offre technique et financière précise tout en fournissant une expertise scientifique ainsi que l’accès aux équipements technologiques de haut niveau.

                    

Nos activités

Nous nous mettons à la disposition des utilisateurs de la plateforme, afin de développer et mener en tant qu’experts un travail scientifique en réponse à une problématique donnée. Deux types de prestations sont proposés : la prestation de service ou le projet de collaboration scientifique (financements de type ANR, PHRC, FRM…). Pour toute demande de tarifs, veuillez nous contacter directement.

 

Services Proposés par la plate-forme :

  • Identification de protéines, peptides en phase liquide ou solide (tissus animaux, végétaux, cultures bactériennes, levures, cellules, liquides biologiques …) :
    • Protéines isolées sur gel d’électrophorèse mono ou bi-dimensionnel
    • Identification des protéines en réalisant la découpe et la digestion automatisée de spots sur gels d’électrophorèse (Proteineer SP™ et Proteineer DP™ Bruker)
    • Mélange peptidique purifié en phase liquide par chromatographie Nano-LC
  • Protéomique quantitative :
    • Développement et mise au point de méthodes d'acquisition en vue d’analyses quantitatives par LC-MS/MS (ICPL)
  • Approche en protéomique clinique :
    • Simplification et purification des échantillons par le biais de billes magnétiques fonctionnalisées (ClinProt™)
    • «Profiling» de protéines et découverte de bio-marqueurs
    • Technique adaptable aux échantillons biologiques : sérum, plasma, urine, liquide céphalo-rachidien, et aux tissus
  • Chimie :
    • Contrôle qualité de molécules de synthèse chimique par spectrométrie de masse

Notre Equipement

Spectrométrie de masse

  • MALDI-TOF/TOF UltraFlex II (Bruker Daltonics)

 

Séparation et détection de protéines, électrophorèse bidimensionnelle

  • IEF : Protean IEF Cell (Biorad)
  • SDS-PAGE : EttanDalt six (GE)

 

Fractionnement chromatographique d’échantillons peptidiques

  • Nano-Chromatographie liquide HPLC (Ultimate™3000NanoLC Dionex) couplée « off line » au collecteur de fraction Proteineer FC (Bruker Daltonics)

 

Robots de préparation d’échantillons

  • Robot exciseur de spots électrophorèse Proteiner SPII ™ (Bruker Daltonics)
  • Robot de digestion Proteiner DP™  (Bruker Daltonics)
  • Robot de « profiling » et de protéomique clinique ClinProt™ (Bruker Daltonics)

 

Outils Bio-Informatiques 

  • Serveur MASCOT  interne (Matrix Sciences) : identification des protéines via les bases de données (UniProt , NCBI…)

 

Nous Contacter 

Sophie Duban-Deweer, Ingénieur de Recherche - sophie.duban[at]univ-artois.fr

Johan Hachani, Ingénieur d’Etudes - johan.hachani[at]univ-artois.fr

 

capa[at]univ-artois.fr

Tél: +33 (0)3 21 79 17 28